可能是目前国际上性能最好的ctDNA高通量测序产品

发布时间:2019-05-14 23:43 来源: 作者:admin

  随着基因测序技术的发展,分析肿瘤相关基因突变正在越来越多地被用于肿瘤诊断、预后判断和治疗。苹果公司已故创始人乔布斯就曾在确诊癌症之后耗费10万美元进行了癌症全基因组测序,但在当时的技术环境下,还只能取材肿瘤组织活检标本,这在实际应用中有很大局限。

  在此后的研究中,科学家发明了液态活检技术,用于检测在血液中死亡的肿瘤细胞里的碎片DNA(ctDNA),通过抽血就可以对全身的肿瘤信息进行检测,实现“一管血”检测癌症,非常适合于癌症的早期诊断和精准医疗。液态活检也成为了肿瘤精准医疗中最炙手可热的技术。

  循环肿瘤DNA(ctDNA)高通量测序技术是液态活检的一种,也是最具前景的。它只需像化验肝肾功能那样采集静脉血,即可对全身的肿瘤基因信息进行精确测定,基于这些肿瘤基因信息,就可以指导抗肿瘤药物选用、疗效评估、预后判断,甚至早期发现和早期诊断。

  但在实际的应用中,由于血浆中ctDNA含量极低,检测十分困难,并且二代测序背景噪声很高,用常规建库测序方使肿瘤信号完全淹没在背景噪声中。ctDNA含量极低、测序结果信噪比很低、测序平台的系统误差是ctDNA的测序方法三大挑战。

  据美国行业内知名媒体GenomeWeb 6月1日报道,癌症诊断公司安可济控股有限公司(Accuragen Holdings Limited)宣布完成4000万美元B轮融资,其核心技术Firefly™技术很好地攻克了ctDNA检测面临的难题。本轮融资由安可济A轮投资方德诚资本与佳辰资本共同领投,淡马锡、德同资本、斯坦福StartX基金、南风资本以及其他A轮投资者共同参与。

  安可济成立于2013年8月,在美国加州硅谷的Menlo Park拥有一个由20多名科学家组成的研发团队,在中国上海拥有一个约45名成员的临床研究及应用推广团队,并已建成一家医学检验所,配置了高标准基因扩增实验室和高通量测序平台,主要致力于肿瘤基因高通量测序研发及其在癌症精准治疗中应用。

  据了解,安可济由应康博士、林盛榕博士和其他几位创始人共同创立。应康博士在基础医学、生物技术、基因科学和商业领域具有雄厚的学术背景和丰富的实践经验。他早年毕业于第二军医大学,获博士学位,并有博士后经历,2000年转业进入复旦大学遗传所任教,2006年辞职创业;曾成功创办和经营了多家科技公司与贸易公司,现任安可济董事会主席兼首席执行官(CEO)。林盛榕博士曾在Illumina研究部担任资深科学家,在美国获得四项专利,他同时也是Firefly™技术发明人,主要负责团队的技术研发与产品开发,现任安可济首席技术官(CTO)。

  安可济其他几位创始人包括:首席信息官(CIO)孙朝辉先生、研发总监赵奇志(Grace Zhao)以及基因组学总监邓(Paul Tang)博士;Sequenta前任首席科学官Malek Faham博士也加入安可济团队担任CSO(Sequanta目前已被Adaptive Biotechnologies收购)。

  安可济团队研发出的循环肿瘤基因高通量测序技术Firefly™技术采用单链环化DNA滚环复制串联重复确认法,相比国际主流的双链DNA分子条码扩增比对确认法,极大提高了复制效率,有效解决了扩增建库过程中极低痕量DNA 片段的选择性扩增偏差,使得后续测序数据能更精确地反映原始DNA 拷贝数,在国际上首次成功实现了ctDNA 的全基因组无差别扩增。

  该技术同时又能够有效地降低随机测序错误导致噪声,大大提高信噪比。在ctDNA 标准品的血浆梯度掺入测试中,检测灵敏度可达到0.02%,测序信号准确性理论上可达到 99.9999%。在解决了微量的循环肿瘤DNA扩增难题的同时,极大地提高了检测灵敏度和特异性,有效解决了ctDNA的测序方法面临的三大挑战。该成果已由研发总监赵奇志博士在3月11日的旧金山分子医学Tri-Conference上发表,获得业内一致好评和认可,被认为是检测灵敏度、准确性、经济性和自动化潜力等性能最好的技术,且具备很强的专利地位。基于该超高精度、超高灵敏度的技术开发的涵盖61个基因测序的安可行™产品已经完成了性能验证,正在中国推进针对不同癌症种类的6个临床合作研究项目。

  应康博士对贝壳社表示,Firefly™技术既可用于肿瘤病人的“精准医疗”,又可发展为肿瘤早期筛查、早期发现、早期诊断的医学辅助诊断新方法。

  在肿瘤病人治疗方面,和传统肿瘤活检相比,其优势有:第一,综合反映癌症的基因突变情况,比肿瘤活检更全面、更灵敏。第二,无损伤探查、实时监测、早期发现、指导和评估个体化用药。在肿瘤的早期诊断方面,通过抽血即可以从分子病理的成因分析和发现体内是否存在肿瘤细胞,有望比现有所有医学检测方法更早、更灵敏地发现肿瘤迹象。正因为具有自主知识产权的独特技术有效解决ctDNA的技术难题,安可济在技术层面上已经在外周血游离DNA测序(液态活检)行业中占据了领先地位,能够为检测和监测常见肿瘤提供更敏感、更准确的检测技术平台。该技术现已在美国及中国都申请了专利保护。

  应康博士还透露,本轮融资的目的在于加强产品持续开发能力的建设,此后安可济还将设立自己的IVD生产企业,进行高通量测序肿瘤IVD产品的生产和注册。目前在国内,安可济已经在中国上海设立了首个医学检验所和商业推广机构,之后将建立和完善相关服务体系,搭建自己的中心实验室平台,完善商业体系和渠道建设,并将从上海扩展到长三角、珠三角、京津冀等其他地区。安可济将不仅仅致力于满足肿瘤临床后诊疗的需求,更期待在未来将该技术平台应用于肿瘤早期辅助诊断,能够帮助患者更及时地获得精准的治疗,从而大大改善肿瘤的生存期和生活质量。

  此前,安可济在去年完成了由德诚资本和戴乐斯资本领投的690万美元A轮融资,参投方还有亿方基金和WS Investment。至此,安可济已累计获得近5000万美元的投资,相信在2-3年后有望成为又一家独角兽公司。